1．比较法
（1）概念：根据一定的标准，把彼此有某种联系的事物加以对照，确定它们的相同和不同之处。
（2）方法：横向比较和纵向比较
（3）意义：把握各个事物之间的 内在联系，认识事物的本质
2．古生物学上的证据――化石
（1）概念：生物的遗体、遗物或生活痕迹，由于种种原因被埋藏在地层中，经过若干万年的复杂变化系形成的。
（2）分类：植物化石、动物化石和印痕化石
（3）意义：①推断生物生存年代以及当时的自然环境②确定生物进化的历程（水生到陆生，低等到高等，简单到复杂，单细胞到多细胞）③证明生命的起源学说（各种生物化石在地层中出现有一定的顺序）
（4）例如：始祖鸟化石（古代爬行动物→古代鸟类）
胚胎学上的证据
比较和研究动植物的胚胎形成和发育过程的方法
1．比较解剖学上的证据
同源器官：指不同生物的某些器官在基本结构、各部分和生物体的相互关系以及胚胎发育的过程彼此相同，但在外形上有时并不相似，功能上也有差别。如鸟的翅膀、蝙蝠的翼膜、鲸的胸鳍、狗的前肢以及人的上肢，虽然具有不同的外形，功能也并不尽同，但却有相同的基本结构
2．比较蛋白质分子的差异
比较各种生物的同一种蛋白质的氨基酸组成，判断生物之间的亲缘关系和进化顺序
3． 生物进化的总体趋势（特点）：简单到复杂，低等到高等，水生到陆生
